Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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