Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP31Q70CQ4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP31Q70CQ4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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USP31Q70CQ4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP31Q70CQ4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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