Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms