Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SDK2Q58EX2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms