Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SBK1Q52WX2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms