Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DUSP28Q4G0W2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms