Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms