Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms