Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL38Q2WGJ6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms