Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC57Q2TAC2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms