Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT16Q17RD7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT16Q17RD7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms