Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK5Q16478 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms