Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNGA3Q16281 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms