Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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