Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNIP1Q15025 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNIP1Q15025 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms