Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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