Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EMC2Q15006 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms