Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CHD4Q14839 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHD4Q14839 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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