Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SPIDRQ14159 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIDRQ14159 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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