Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CBFBQ13951 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms