Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms