Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CUL4AQ13619 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4AQ13619 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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