Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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