Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CAMK2BQ13554 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms