Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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IKZF1Q13422 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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IKZF1Q13422 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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