Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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