Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K1Q13233 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAP3K1Q13233 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms