Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TRIM32Q13049 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM32Q13049 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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