Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NPRL3Q12980 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPRL3Q12980 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms