Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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FOXF2Q12947 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXF2Q12947 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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