Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TWF1Q12792 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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