Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SREBF2Q12772 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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