Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE4DQ08499 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms