Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCDH1Q08174 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCDH1Q08174 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms