Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN11Q06124 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms