Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DEUP1Q05D60 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms