Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC02525-202ENST00000435043 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ETFBKMT-204ENST00000538391 1067 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC02246-207ENST00000630354 524 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms