Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms