Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC00370-201ENST00000455487 698 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LINC02445-201ENST00000551387 459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB1Q02641 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms