Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms