Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMF1P82094 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMF1P82094 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMF1P82094 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMF1P82094 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMF1P82094 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms