Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LOXL3P58215 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms