Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER3P43115 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGER3P43115 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms