Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM5CP41229 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5CP41229 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms