Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms