Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms