Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL9P32969 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL9P32969 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms