Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms