Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA13P31271 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXA13P31271 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms