Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBL1P28749 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBL1P28749 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBL1P28749 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms